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植物圖像分析

PhenoGA植物表型分析測量儀

PhenoGA植物表型分析測量儀系統
Instrument for Measuring plant phenotype — Model PhenoGA 

一、用途
基因型、表型和環境是遺傳學研究的鐵三角。表型(性狀)是基因型和環境共同作用結果,而基因型與表型之間有著多重關系。研究者用測序和基因組重測序來評估等位基因差異定位數量性狀等已變得很普遍,但其需大量性狀數據來佐證。然而這類分析測量的結果受人員、工具和環境等的干擾很大,還會損傷到植物。高效、準確的萬深PhenoGA植物表型分析測量儀實現了可視化的精確數據分析和表型測試,如測試對壓力和環境因素的表型反應、生態毒理學測試或萌發測定、遺傳育種研究、突變株篩選、植物形態建模、生長研究等。

二、主要性能指標
1、成像

(1)雙彩色相機:由頂視和側視的超大變焦鏡頭自動對焦2400萬像素以上的佳能EOS單反相機直連電腦獲取植物頂視和側視的RGB彩色圖。
(2)紅外光雙目3D相機:由頂部的主動紅外光的雙目3D相機(點云密度1024*1024像素)來獲取植物冠層的3D景深偽彩色圖和可轉換視角的3D重建偽彩色圖。
(3)拍攝箱:外尺寸200cm高*120cm長*120cm寬,可成像分析植株高可達150cm、可測最大葉冠幅115cm*115cm。
2、分析軟件
(1)常規分析:投影葉面積及其動態變化,外周長,外接圓直徑及面積,擬合橢圓主副軸及偏角,凸包內徑、面積及周長,植株高、寬,最小外接矩形長、寬,植株緊實度。
(2)顏色分析:RGB、LAB顏色值,具有葉片顏色自動矯正特性,可按英國皇家園林協會RHS比色卡2015版來自動比色。可按指定顏色數進行聚類分割,并統計顏色分布及面積占比。
(3)骨架分析:骨架長度,端點數(葉片數),分叉數(分枝數、分節數),莖葉夾角等。
(4)玉米株形分析:葉片數,葉片長、寬,葉片彎曲度,葉片投影面積,莖稈分節數,分節長、粗,葉片顏色等,并可編輯。
(5)生長分析:植株絕對生長、相對生長曲線,相對生長趨勢。
(6)根系分析:根長,根粗,根尖數等(要求根粗>1mm)。
(7)考種分析:種粒數,種粒面積,種粒長、寬(種粒直徑>2mm,不粘連),分析種子形態、果實外觀品質、花形和花色。
(8)其它:不同生長時期自動批量化處理分析,多植株網格分析,直線、角度等幾何測量,各測量結果可編輯修正。
3、數據報表
(1)可接入條碼槍來自動刷入樣品編號,具有按條碼標識跟蹤分析的特性。
(2)各項分析數據和標記圖片可導出。

三、標準配置
1、萬深PhenoGA植物表型分析測量儀軟件光盤及軟件鎖1套
2、超大變焦鏡頭自動對焦2400萬像素以上的佳能EOS單反相機2套
3、主動紅外光的雙目3D相機(深度相機+RGB相機)及適配器1套
4、單反相機拍攝支架1套
5、含光源的拍攝箱(200cm高*120cm長*120cm寬)1套
6、葉色色彩矯正板+尺寸自動標定板及其座板 1付
7、可承重25kg盆栽植株的升降臺1付
8、可承重25kg電動轉臺1套
9、手持式條形碼閱讀器1付
10、超薄背光燈板1付
11、掌式便攜小背光板1付
12、品牌電腦(12代酷睿i5 CPU / 16G內存/ 512G硬盤以上 / 23”彩顯/無線網卡,2個USB3.0和2個USB2.0口,Windows 完整專業版)1臺

四、可選配硬件

1、紅外熱成像相機(分辨率 384*288像素,測溫范圍-20-150℃,測溫精度為最大測溫范圍絕對值的±2%),以測定葉溫和葉溫分布。
2、近紅外成像相機(NIR),以定性分析植物葉片水分分布情況。
3、真正3D成像的手持式掃描儀,以獲得植物真3D模型。
4、可定制大到250cm高*120cm長*120cm寬的拍攝箱,或田間頂視檢測版的分析儀,以適應特殊應用需求。
5、LA-S手機版葉面積分析軟件,可用于野外的方便成像與分析葉面積。
6、RootGA根系動態生長監測分析儀,以分析植株根系的脅迫響應等。

玉米株形分析
生長分析
葉冠顏色分析

花朵顏色分析
玉米骨架分析
油菜頂視圖表型分析
油菜側視圖表型分析
水稻頂視圖葉片數統計
水稻側視圖表型分析
根長、根粗測量
多植株表型分析
多植株表型分析
種粒計數分析
多葉分析
單葉分析

水稻生長動態變化分析圖

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